É especialmente indicado para a metafilaxia e tratamento da coccidiose em leitões, causada por Isospora suis, o principal patógeno associado com a diarreia em leitões entre 5 e 30 dias de idade; para metafilaxia e tratamento da coccidiose em bezerros e cordeiros, causada por Eimeria spp., e principalmente por Eimeria bovis, Eimeria alabamensis e Eimeria zuernii, importantes patógenos associados com a diarreia em bezerros, especialmente a diarreia negra, e Eimeria crandallis e Eimeria ovinoidalis associadas à diarreia em cordeiros. Baycox 5% é compatível com a administração de antibióticos.
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